Atölye endüstriyel mobil FFU hava temizleme cihazının çalışma prensibi aşağıdaki gibidir:
Fan etkinleştirildiğinde güçlü bir emme kuvveti oluşturarak atölyenin içindeki havayı FFU'ya çeker. Hava önce toz ve deri pulları gibi daha büyük parçacıkların giderildiği bir ön filtreden geçer. Daha sonra ön arıtılmış hava, yüksek verimli filtreye girer. Buradaki filtre, çapı 0,3 mikrometreden küçük parçacıkları %99,99'un üzerinde bir filtreleme verimliliğiyle yakalayabilmektedir. Son olarak çift filtrelenen temiz hava, fan aracılığıyla temiz atölyeye geri üflenerek sürekli bir hava akışı sirkülasyonu oluşturularak atölye içerisinde temizlik sağlanır.
Özetle, FFU hava temizleme cihazı kirli havayı çekerek, zararlı parçacıkları ve mikroorganizmaları birden fazla filtreleme aşaması yoluyla filtreleyerek ve ardından temiz havayı tekrar çevreye dağıtarak atölyede yüksek düzeyde hava temizliği sağlayarak çalışır.